NAR+Transcription+STAR Protoc | 季雄团队在基因表达调控领域取得进展
北京大学生命科学学院

NAR+Transcription+STAR Protoc | 季雄团队在基因表达调控领域取得进展

染色质的三维结构被划分为不同的层次单位,包括染色质疆域、A/B区室、拓扑学相关结构域(TADs)、增强子-启动子环等。尽管相关研究已经进行了数十年,但是染色质结构的建立、维持和调控的分子机理仍然不完整。其中,染色质相关调控因子的发现是研究染色质三维结构调控机理的瓶颈之一。

2023-06-04 1539
附属北京天坛医院李子孝/王拥军教授团队《Sci Bull》发现感染可能是急性缺血性卒中患者“低LDL-C-高院内死亡风险”的重要原因
首都医科大学

附属北京天坛医院李子孝/王拥军教授团队《Sci Bull》发现感染可能是急性缺血性卒中患者“低LDL-C-高院内死亡风险”的重要原因

2023年5月,首都医科大学附属北京天坛医院神经病学中心李子孝教授、王拥军教授团队在《Science Bulletin》发表了题为“U-shaped association between low-density lipoprotein cholesterol levels and risk of all-cause mortality mediated by post-stroke infect

2023-06-04 1600
Advanced Science|陆剑课题组与合作者揭示新冠病毒密码子演化规律并提出mRNA疫苗优化策略
北京大学生命科学学院

Advanced Science|陆剑课题组与合作者揭示新冠病毒密码子演化规律并提出mRNA疫苗优化策略

2023年6月2日,北京大学生命科学学院陆剑课题组与中国医科院病原生物学研究所钱朝晖课题组合作,在Advanced Science杂志在线发表了题为Optimization and deoptimization of codons in SARS-CoV-2 and related implications for vaccine development的论文。

2023-06-03 1572
樊东升/高召兵/贾怡昌研究团队在Cell Research发表肌萎缩侧索硬化致病研究的最新成果
北京大学医学部

樊东升/高召兵/贾怡昌研究团队在Cell Research发表肌萎缩侧索硬化致病研究的最新成果

近日,北京大学第三医院神经内科樊东升教授、中科院药物所高召兵教授、清华大学医学院贾怡昌教授联合研究团队,在国际高水平期刊、Nature杂志子刊Cell Research在线发表封面(2023第七期)文章,题目为《内质网阴离子通道维持的离子稳态破坏导致肌萎缩侧索硬化病理改变》(‘Disruption of ER ion homeostasis maintained by an ER anion ch

2023-06-02 1405
隋森芳院士团队在Nature上发文揭示核孔复合体转运核糖体前体的分子机制
清华大学生命科学学院

隋森芳院士团队在Nature上发文揭示核孔复合体转运核糖体前体的分子机制

NPC(核孔复合体)是细胞内最庞大、最复杂的分子机器之一,是介导生物大分子进行核质转运的唯一通道,参与细胞内众多重要的生命活动,其功能的紊乱能够引起包括癌症在内的多种严重的疾病。近年来,通过整合冷冻电镜技术、X射线晶体学、质谱学和人工智能等技术,NPC的三维结构正在逐步得到解析。然而,关于其核质转运的分子机制仍然是不清楚的。核糖体是NPC转运的最具代表性的生物大分子组装体之一,负责合成生命的基

2023-06-02 1528
Nucleic Acids Research | 李湘盈课题组解析红细胞发育各阶段的多维度染色质动态
北京大学生命科学学院

Nucleic Acids Research | 李湘盈课题组解析红细胞发育各阶段的多维度染色质动态

红细胞是人体中数目最多的血细胞,健康人体每天会新生约二十亿个红细胞以替代受损或失去的红细胞,其发育过程的障碍会导致各类贫血疾病的发生,例如先天性纯红再障(DBA)等 [1-3]。理解红细胞发育的动态改变及机制对贫血类疾病的研究和治疗具有极大的基础生物学及转化意义。红细胞来源于造血干细胞,其发育可以被分为两个阶段:具有强大的自我更新能力的红系祖细胞和能够快速分化脱核的红系前体细胞阶段。

2023-06-01 1172
Systematic Biology | 张蔚课题组和合作者开发基于深度学习的基因渐渗推断方法
北京大学生命科学学院

Systematic Biology | 张蔚课题组和合作者开发基于深度学习的基因渐渗推断方法

解决分类群之间的演化关系是演化生物学的基本任务之一。在大数据时代,随着测序技术和分析方法的发展,多项研究发现类群之间的杂交和基因渐渗可能强烈的影响了生命之树,并在物种形成和适应过程中起到了重要作用。然而,现有基因渐渗检测方法仍具有一定局限性,如依赖大样本量、受限的系统发育关系或精确的种群演化历史等。因此,在基因流广泛存在的背景下,评估物种之间的复杂关系仍具挑战。同时,基于深度学习的算法已经迅

2023-06-01 1445
上海交大李雷课题组综述独特微生物资源生物合成潜能释放新方法
上海交通大学生命科学学院

上海交大李雷课题组综述独特微生物资源生物合成潜能释放新方法

近日,上海交通大学李雷课题组应邀在合成生物学领域国际知名期刊《Biotechnology Advances》发表题为“Accessing hidden microbial biosynthetic potential from underexplored sources for novel drug discovery”的综述文章,针对不同生境的未充分挖掘的独特微生物资源,梳理了三类天然产物高通量

2023-06-01 1496
脯氨酸羟基化修饰调控2型糖尿病的新机制
生物通-国内研究进展

脯氨酸羟基化修饰调控2型糖尿病的新机制

中国科学院上海营养与健康研究所、西南医科大学附属医院和青岛大学研究人员首次解析脯氨酸羟基化修饰调控2型糖尿病进展的新机制,揭示了脯氨酸羟化酶3(PHD3)通过羟基化增加糖异生关键转录因子CRTC2的核定位与活性,进而增加肝脏糖异生基因表达和葡萄糖产生。该研究成果于5月30日在《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表。   肝脏作为重要的内分泌器官,肝脏糖代谢在维持机体血糖稳态中扮演着重要角色

2023-06-01 1394
心脏内科陈晓平教授团队在STTT发文:系统总结分子信号通路在血管功能调节和高血压治疗中的作用
生物通-国内研究进展

心脏内科陈晓平教授团队在STTT发文:系统总结分子信号通路在血管功能调节和高血压治疗中的作用

近日,我院心脏内科陈晓平教授团队在国际顶级学术期刊Signal Transduction and Targeted Therapy (IF:38.104)发表长文综述:Signaling pathways in vascular function and hypertension: molecular mechanisms and therap

2023-06-01 1467
陈学峰课题组在《自然·通讯》发表DNA同源重组修复的新调控机制
武汉大学生命科学学院

陈学峰课题组在《自然·通讯》发表DNA同源重组修复的新调控机制

2023年5月25日,武汉大学生命科学学院、泰康生命医学中心、免疫与代谢前沿科学中心陈学峰教授课题组在Nature Communications 杂志上发表了题为Bre1/RNF20 promotes Rad51-mediated strand exchange and antagonizes the Srs2/FBH1 helicases的研究成果

2023/05/30 1745
《Nature Medicine》阿尔兹海默症新的血液生物标志物
生物通-国外研究进展

《Nature Medicine》阿尔兹海默症新的血液生物标志物

  阿尔茨海默病是一种神经退行性疾病,会导致进行性记忆丧失和痴呆,使患者丧失许多富有成效的生命。在组织层面上,阿尔茨海默氏症的标志是淀粉样斑块的积累——大脑神经细胞之间的蛋白质聚集体——以及神经元内部形成的被称为tau缠结的无序蛋白质纤维团块。几十年来,脑科学家认为淀粉样斑块和tau蛋白缠结的积累不仅是阿尔茨海默病的征兆,也是其直接罪魁祸首。

2023-05-31 826
Molecular Cell | 西湖大学施一公团队再获新进展!解析人类pre-tRNA剪接机制,完善
生物探索-技术研究

Molecular Cell | 西湖大学施一公团队再获新进展!解析人类pre-tRNA剪接机制,完善

从tRNA前体 (pre-tRNA)中去除内含子在生命的三个王国中都是必不可少的。在人类中,这一过程是由tRNA剪接内切酶(TSEN)介导的,包括四个亚基:TSEN2、TSEN15、TSEN34和TSEN54。2023年4月6日,西湖大学施一公团队在Molecular Cell (IF=19)在线发表题为“Structural basis of pre-tRNA intron removal

2023-05-31 956
陈振国/孙蕾/舒易来合作报道Pendrin蛋白的离子交换机制研究
复旦大学上海医学院

陈振国/孙蕾/舒易来合作报道Pendrin蛋白的离子交换机制研究

先天性耳聋并发甲状腺肿大的临床表现被命名为“Pendred 综合征”,分子生物学研究确定了这些病理变化由基因PDS编码的pendrin功能失调引起。PDS是全球性的遗传性听力损失相关的重要基因。在耳聋变异数据库中有超过8000条与pendrin相关的突变记录。因此,对pendrin的分子机理研究不仅可以促进人们对离子交换的基本生理过程的了解,同时也对相关的耳聋等疾病的发生和治疗研究至关重要。

2023-05-31 1702
Nature Communications|陈振国/孙蕾合作团队报道Pendrin蛋白的离子交换机制研究
复旦大学生物医学研究院

Nature Communications|陈振国/孙蕾合作团队报道Pendrin蛋白的离子交换机制研究

1960年,有科学家将先天性耳聋并发甲状腺肿大的临床表现,命名为了“Pendred 综合征”。随后,分子生物学研究确定了这些病理变化由基因PDS编码的pendrin功能失调引起。同时,pendrin在肾脏也有低水平的表达。1999年前后,Pendrin被确定为了钠离子非依赖性的Cl-/HCO3-和Cl-/I-交换体。

2023-05-30 879
Nature Aging:刘光慧团队合作揭示 RNA m6A 修饰调控器官老化的分子机制
生物探索-技术研究

Nature Aging:刘光慧团队合作揭示 RNA m6A 修饰调控器官老化的分子机制

m6A 是目前已知的真核细胞 mRNA 上最为常见的一类化学修饰,它的建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A 能够通过调节 mRNA 的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包括胚胎发育、肿瘤以及神经退行性疾病的发生等。然而,在生理性衰老过程中,m6A 对于

2023-05-29 910
首次!德国Alessandra Moretti教授研究13年后,这颗“迷你心脏”类器官终于拥有了
生物探索-技术研究

首次!德国Alessandra Moretti教授研究13年后,这颗“迷你心脏”类器官终于拥有了

来自德国慕尼黑大学的Alessandra Moretti教授与同事先后在Nature Biotechnology和Nature Communication两本杂志发表论文,用单细胞测序技术揭开了心脏发育过程中的新型分子机制,为研究先天性心脏病和用干细胞治疗心肌损伤提供了治疗的可能性。 Moretti教授和她的团队是世界上第一批成功创建包含心肌细

2023-05-29 1537
北京师范大学张俊杰课题组发现肿瘤细胞中缺氧诱导Autotaxin表达的分子机制
北京师范大学生命科学学院

北京师范大学张俊杰课题组发现肿瘤细胞中缺氧诱导Autotaxin表达的分子机制

溶血磷脂酸(lysophosphatidic acid,LPA)一种生物活性脂质分子,可以与细胞膜上的LPA受体结合,激活下游信号通路,具有抗凋亡、促迁移和促进血管形成等多方面的功能。Autotaxin (ATX)是催化LPA生成的关键酶,已有的研究表明ATX-LPA信号轴在肿瘤的发生发展中有重要的作用。 但是,在一些上皮肿瘤细胞(如人结肠癌细胞 SW480 和 DLD1、人宫颈癌细胞 HeLa)

    20 2148
生命科学学院张俊杰课题组发现ATX表观遗传调控新机制及其在肿瘤治疗中的作用
北京师范大学生命科学学院

生命科学学院张俊杰课题组发现ATX表观遗传调控新机制及其在肿瘤治疗中的作用

Autotaxin(ATX)是由ENPP2基因编码的分泌型糖蛋白,是胞外溶血磷脂酸(LPA)产生的关键酶。LPA 作为一种生物活性脂类,作用于细胞膜表面的LPA 受体(LPA1-6),激活多种胞内信号通路,并调控增殖、迁移和侵袭等细胞活动。ATX-LPA 轴在肿瘤发生发展中发挥关键作用,被认为是肿瘤治疗的靶点。人们对ATX表达的调控机制尤其是表观遗传调控机制仍知之甚少,因此探究ATX表达的表观遗传

    20 2122
Mol Biol Evol | 高歌课题组提出基因丢失鉴定新方法
北京大学生命科学学院

Mol Biol Evol | 高歌课题组提出基因丢失鉴定新方法

作为细胞中基本的功能单位,蛋白编码基因(Protein-coding genes,以下简称基因)可以通过转录-翻译过程指导合成对于生命活动至关重要的蛋白质,进而影响生命体的生理/病理性状。因此,基因的演化与生物体的表型演化息息相关,是介导物种特异性表型及其环境适应的重要动力之一。

2023-05-29 1463