PNAS | d北京大学邓兴旺实验室朱丹萌课题组取得植物转录抑制调控分子机制研究突破

多细胞生物的生长发育伴随着特定基因类群时空特异性的转录激活与抑制调控,深入解析转录调控的分子机制具有重要意义。转录抑制复合体DREAM (dimerization partner, RB-like, E2F and multi-vulval class B) 在真核生物细胞周期调控中发挥关键作用,为细胞维持分裂静止状态所必需,主要抑制DNA复制及细胞分裂相关基因转录。
2022-06-28

Plant Communications | 邓兴旺实验室何光明课题组揭示植物协调生长和抗病的分子机制

当受到病原菌攻击时,植物需要将生长的能量重新分配到防御上,以抵御入侵者,这常常会导致植物生长受到抑制,这种现象被称为生长-抗性平衡现象。如何打破这种平衡以实现生长-抗性双优在农作物育种上具有重要的应用的价值。
2022-06-28

Nature Communications | 上海交大张晨虹团队合作研究系统性揭示运动及饮食干预脂肪肝的改善效果与个体肠道菌群网络的联系

5月10日,Nature Communications在线发表了上海交通大学运动转化医学中心(系统生物医学研究院/体育系)程蜀琳团队、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈洛南研究组与上海交通大学生命科学技术学院张晨虹团队的合作研究成果 A randomized controlled trial for response of microbiome network to
2022-05-11

Nucleic Acids Research | 上海交大欧竑宇研究组发展病原菌耐药移动元件的一键式分析软件

近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室欧竑宇研究组在分子生物学知名刊物Nucleic Acids Research上发表题为“VRprofile2: detection of antibiotic resistance-associated mobilome in bacterial pathogens”的研究论文。该论文报道了病原菌耐药移动元件一键式分析的新软件VRprof
2022-05-09

Phytopathology Research | 上海交大何亚文团队在植物病原黄单胞菌致病机制领域取得重要进展

近日,中国植物病理学会与中国农业大学联合出版的英文国际期刊Phytopathology Research在线发表了上海交通大学生命科学技术学院何亚文教授团队的研究文章“黄单胞菌利用hca基因簇降解和利用宿主酚酸,增强致病力”
2022-05-09

Nature Communications | 上海交大邓子新团队合作揭示超级抗生素darobactin的生物合成机制

近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室邓子新教授团队在《Nature Communications》合作发表了题为“Radical SAM-dependent ether crosslink in daropeptide biosynthesis”的研究论文,首次揭示了超级抗生素darobactin的双环形成机制。生命科学技术学院硕士研究生郭思佳和复旦大学博士后王舒为论文并列
2022-05-01

Physical Chemistry Chemical Physics | 上海交大赵一雷团队发现硫修饰DNA的新型硫键在碘切反应和SBD蛋白识别中具有特殊意义

近日,综合性权威杂志《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》和物理化学专业期刊《Physical Chemistry Chemical Physics》上发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队在硫修饰DNA研究的最新进展,
2022-04-21

mBio | 上海交大吴更团队合作阐明古菌DNA磷硫酰化修饰途径中的重要蛋白DndE的结构和功能

近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室的吴更教授团队与武汉大学王连荣教授团队合作,阐明了古菌DNA磷硫酰化修饰途径中的重要蛋白DndE的结构和功能。该研究成果以“Structural and functional analysis of DndE involved in DNA phosphorothioation in the haloalkaliphilic archae
2022-04-21

Genome Research | 上海交大韦朝春团队合作开发基于三代测序数据构建水稻泛基因组新方法

近日,上海交通大学生命科学技术学院韦朝春团队和中国农业科学院作物科学研究所合作完成基于三代测序数据的水稻泛基因组构建及分析,相关成果论文 “Long-read sequencing of 111 rice genomes reveals significantly larger pan-genomes”在基因组学顶级期刊《Genome Research》在线发表。
2022-04-18

Genome Biology |上海交大王涛团队基于零膨胀概率主成分分析模型的微生物组数据去噪新方法mbDenoise

近日,国际权威期刊《Genome Biology》在线发表了生命科学技术学院王涛团队的研究成果“mbDenoise: microbiome data denoising using zero-inflated probabilistic principal components analysis”。该研究提出基于零膨胀概率主成分分析的统计模型和变分近似算法对微生物组数据进行去噪
2022-04-15
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