PNAS | d北京大学邓兴旺实验室朱丹萌课题组取得植物转录抑制调控分子机制研究突破
多细胞生物的生长发育伴随着特定基因类群时空特异性的转录激活与抑制调控,深入解析转录调控的分子机制具有重要意义。转录抑制复合体DREAM (dimerization partner, RB-like, E2F and multi-vulval class B) 在真核生物细胞周期调控中发挥关键作用,为细胞维持分裂静止状态所必需,主要抑制DNA复制及细胞分裂相关基因转录。
Plant Communications | 邓兴旺实验室何光明课题组揭示植物协调生长和抗病的分子机制
当受到病原菌攻击时,植物需要将生长的能量重新分配到防御上,以抵御入侵者,这常常会导致植物生长受到抑制,这种现象被称为生长-抗性平衡现象。如何打破这种平衡以实现生长-抗性双优在农作物育种上具有重要的应用的价值。
Nature Communications | 上海交大张晨虹团队合作研究系统性揭示运动及饮食干预脂肪肝的改善效果与个体肠道菌群网络的联系
5月10日,Nature Communications在线发表了上海交通大学运动转化医学中心(系统生物医学研究院/体育系)程蜀琳团队、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈洛南研究组与上海交通大学生命科学技术学院张晨虹团队的合作研究成果 A randomized controlled trial for response of microbiome network to
Nucleic Acids Research | 上海交大欧竑宇研究组发展病原菌耐药移动元件的一键式分析软件
近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室欧竑宇研究组在分子生物学知名刊物Nucleic Acids Research上发表题为“VRprofile2: detection of antibiotic resistance-associated mobilome in bacterial pathogens”的研究论文。该论文报道了病原菌耐药移动元件一键式分析的新软件VRprof
Phytopathology Research | 上海交大何亚文团队在植物病原黄单胞菌致病机制领域取得重要进展
近日,中国植物病理学会与中国农业大学联合出版的英文国际期刊Phytopathology Research在线发表了上海交通大学生命科学技术学院何亚文教授团队的研究文章“黄单胞菌利用hca基因簇降解和利用宿主酚酸,增强致病力”
Nature Communications | 上海交大邓子新团队合作揭示超级抗生素darobactin的生物合成机制
近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室邓子新教授团队在《Nature Communications》合作发表了题为“Radical SAM-dependent ether crosslink in daropeptide biosynthesis”的研究论文,首次揭示了超级抗生素darobactin的双环形成机制。生命科学技术学院硕士研究生郭思佳和复旦大学博士后王舒为论文并列
Physical Chemistry Chemical Physics | 上海交大赵一雷团队发现硫修饰DNA的新型硫键在碘切反应和SBD蛋白识别中具有特殊意义
近日,综合性权威杂志《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》和物理化学专业期刊《Physical Chemistry Chemical Physics》上发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队在硫修饰DNA研究的最新进展,
mBio | 上海交大吴更团队合作阐明古菌DNA磷硫酰化修饰途径中的重要蛋白DndE的结构和功能
近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室的吴更教授团队与武汉大学王连荣教授团队合作,阐明了古菌DNA磷硫酰化修饰途径中的重要蛋白DndE的结构和功能。该研究成果以“Structural and functional analysis of DndE involved in DNA phosphorothioation in the haloalkaliphilic archae
Genome Research | 上海交大韦朝春团队合作开发基于三代测序数据构建水稻泛基因组新方法
近日,上海交通大学生命科学技术学院韦朝春团队和中国农业科学院作物科学研究所合作完成基于三代测序数据的水稻泛基因组构建及分析,相关成果论文 “Long-read sequencing of 111 rice genomes reveals significantly larger pan-genomes”在基因组学顶级期刊《Genome Research》在线发表。
Genome Biology |上海交大王涛团队基于零膨胀概率主成分分析模型的微生物组数据去噪新方法mbDenoise
近日,国际权威期刊《Genome Biology》在线发表了生命科学技术学院王涛团队的研究成果“mbDenoise: microbiome data denoising using zero-inflated probabilistic principal components analysis”。该研究提出基于零膨胀概率主成分分析的统计模型和变分近似算法对微生物组数据进行去噪
Cell Research | 李程组与合作者揭示CTCF通过相分离调控染色质长距离互作的非经典模型
2022年6月29日,中山大学丁俊军研究团队与北京大学李程研究团队在Cell Research上发表最新研究成果。该研究首次揭示了染色质结构因子CTCF除介导经典环挤压模型调控较短距离(小于2Mb)的染色质互作外,还可通过非经典相分离模型介导极长距离(大于10Mb)、跨染色质区室的染色质互作,并参与基因表达调控。
CELL DEATH DIFFER | 北京大学郑晓峰课题组揭示去泛素化酶OTUD6A通过增加TopBP1稳定性调控 肿瘤细胞耐药和乳腺癌发展的机制
近日Cell Death and Differentiation期刊在线发表了北京大学生科院及蛋白质与植物基因研究国家重点实验室郑晓峰研究组的题为“Deubiquitinase OTUD6A promotes breast cancer progression by increasing TopBP1 stability and rendering tumor cells resistant to
CELL MOL LIFE SCI | 郑晓峰课题组揭示PRMT5通过影响PML-RARα稳定性调控 急性早幼粒细胞性白血病发展的新机制
近日Cellular and Molecular Life Sciences期刊在线发表了生命科学学院郑晓峰研究组的题为“PRMT5-mediated RNF4 methylation promotes therapeutic resistance of APL cells to As2O3 by stabilizing oncoprotein PML-RARα”的长篇研究文章。该研究发现精氨酸甲
Science Advances | 北京大学李毅课题组发文揭示微量元素铜增强水稻抗病毒分子机制
近日,Science Advances发表了来自北京大学生命科学学院李毅课题组的“The key micronutrient copper orchestrates broad-spectrum virus resistance in rice”研究论文(2022,Vol.8, issue 26.DOI:10.1126/sciadv.abm0660),揭示了重要微量元素铜介导的水稻广谱抗病
NATL SCI REV | 北京大学李毅课题组和合作者联合揭示当前水稻生产极易遭受虫媒病毒的侵害
水稻是世界重要粮食作物之一,其产量对粮食安全至关重要。由媒介昆虫传播的水稻病毒病害严重威胁水稻安全生产。病毒病害发生的爆发性和间歇性,导致至今还没有可持续和绿色控制水稻病毒病害的手段。近日,北京大学李毅教授课题组和福建农林大学吴建国教授课题组联合加州大学丁守伟教授和中国农科院水稻所钱前院士等在National Science Review发表题为:“Current rice product
New Phytologist | 李磊研究组发现铜稳态调控拟南芥乙烯响应的新机制
2022年7月13日,北京大学生命科学学院李磊研究组在New Phytologist杂志在线发表了题为“The carboxy terminal transmembrane domain of SPL7 mediates interaction with RAN1 at the endoplasmic reticulum to regulate ethylene signaling in Arab
Environmental Science & Technology | 姚蒙研究组研发新型固态吸附eDNA采集器
2022年7月20日,北京大学生命科学学院和生态研究中心姚蒙研究组在Environmental Science & Technology在线发表题为“Comparative Evaluation of Common Materials as Passive Samplers of Environmental DNA”的研究论文。该研究通过室内控制实验和野外实验评估了12种不同类型的吸附材料和滤膜对
NUCLEIC ACIDS RES | 郭强课题组和合作者发展分析细胞内生物大分子拓扑结构的新方法
近日,北京大学郭强课题组在Nucleic Acids Research 杂志在线发表了题为“A transformation clustering algorithm and its application in polyribosomes structural profiling”的研究文章,并被评选为“突破进展(NAR Breakthrough Article)”。在本项工作中,研究者发展了一
Nature Plants | 焦雨铃课题组发现小麦增产的新基因
对于主要作物,每穗粒数是决定产量的三要素之一。小麦穗通过一次分枝形成小穗,小穗上再形成小花并进而发育为麦粒。适度增加小穗数是提高产量的重要途径。2022年7月18日北京大学生命科学学院焦雨铃课题组在Nature Plants发表了题为“Improving bread wheat yield through modulating an unselected AP2/ERF gene”的研究论
Cell | 张蔚课题组以枯叶蛱蝶属为例揭示山地生物多样性演化和遗传机制
生物多样性包括物种多样性、遗传多样性和生态系统多样性,其成因是生物学中的核心问题之一。陆地环境中,山区生态系统蕴藏着异常多样的陆地生物多样性,可能的解释包括巨大的海拔梯度变化形成了多样的微环境,促进了种群的分化[1]。因此,山地生物区系及其与低地生物多样性热点的关系为人们理解多样性的形成原因提供了重要的切入点。