第二期二阶段任务1——Ｒ语言读取Pubmed接口获得初步数据

真·科研狗 2018-01-09 22:08:16 阅读: 2039

第二期二阶段正式开始，初步计划是2个星期一次作业，任务发布一个星期后发布原始的代码。

第二阶段的的任务之间都是关联的，后面的任务是以前面的任务为基础，所以每一个任务都要熟悉一步一步做。

本期任务：熟悉pubmed接口，获得基本的数据。

用到的包： httr、xml2

pubmed接口学习页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25500/

搜索API：https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi

获取API：https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/fetch.fcgi

任务1. 获得CELL杂志2017年发表文章总数。

任务2. 用CELL杂志2017年中任意发表的文章Pubmedid，得到该文章的title和abstract

pubmedid='29275861,29275860'
...你的代码
title=...
abstract=...
print(title)
print(abstract)

输出如下，得到了标题和abstract.这些数据是我们下一期中用于分词并存入数据库的基础。

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