R2-12 第二阶段第一次

pcr狗 2018-01-23 21:51:46 阅读: 1152

#task1

library(httr)

cell2017<-'https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&term=cell[journal]+AND+2017[pdat]&usehistory=y&retmode=json'

result_cell<-POST(cell2017)

content1<-content(result_cell)

searchresult<-content1$esearchresult

count1<-searchresult$count

print(count1)

#task2

pubmedid<-'29249359,29249360'

download_at<-'https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi'

t2<-POST(download_at,

body = list(

db='pubmed',

id=pubmedid,

retmode='xml'

)

library(xml2)

content2<-content(t2)

article<-xml_children(content2)

count=length(article)

cnt=1

while(cnt<=count){title=xml_find_first(article[cnt],".//ArticleTitle")

abstract=xml_find_first(article[cnt],".//AbstractText")

print(xml_text(title))

print(xml_text(abstract))

cnt = cnt + 1

}

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