化学发光双脱氧DNA测序实验
1. 在微量离心管中混匀下列试剂,配制DNA摸板混合物
(1)1 μg 单链DNA模板或1~3 μg 变性双链DNA模板
(2)0.5 pmol 生物素酰化DNA测序引物
(3)2 μl 5×Bst反应缓冲液
(4)加水至11 μl
(5)加热至70℃,然后在30 min 以上的时间內,慢慢冷却至30 ℃
2. 当模板混合物冷却的同时,各取2 μl 小份的A、C、T、G引物终止混合液,加于4个独立的微量离心管或微量滴定板的孔中,然后做好A、C、G、T的标志。
3. 在65℃预热盛有终止混合物的管子或滴定板。
4. 加入1 μl Bst DNA聚合酶于步骤1冷却后的模板混合物中。
5. 步骤2准备好的每个引物终止混合物中,各加入2.5 μl 聚合酶/模板混合液,于65℃温育5 min。
6. 用水将20×追加溶液贮液稀释成1×追加溶液,往每个样品管或孔中各加入2 μl 1×追加溶液,于65℃温育5 min。
7. 各管或孔中加入4 μl终止溶液。
8. 准备好标准的0.2~0.4 mm 厚含8 mol/l 尿素的测序胶。
9. 加样前,样品于80℃温育2 min,置于冰浴,加样2~3 μl,电泳,监测示踪染料的迁移。
10. 剪三张与凝胶大小刚好或稍大的Whatman 3MM 滤纸,剪下一片能盖过凝胶需转移 区域的尼龙膜。
11. 拆卸凝胶装置,分开玻璃平板。
12. 将一张Whatman 3MM 干滤纸放于凝胶上,然后通过剥起滤纸小心将凝胶揭起。
13. 将贴着凝胶的滤纸,胶面朝上放在玻璃平板上。
14. 将尼龙膜浸没TBE缓冲液中,或用喷水瓶喷射TBE缓冲液使之完全润湿。
15. 小心将湿润的膜放在凝胶上,用吸管或平滑的玻璃棒在膜上滚动以排去气泡。
16. 在膜的上面放两张Whatman 3MM 干滤纸,滤纸上放另一块玻璃平板并在其上加以2~4 kg 重物,转移1 h。
17. 分离测序胶/膜夹层,小心从凝胶上剥下膜,并用铅笔在膜与凝胶接触的一面作好标志,将膜放在滤纸上,晾干约10 min。
18. 使用紫外线交联装置,紫外透照仪或手恃式紫外灯,照射转印膜以固定DNA,总紫外线照量为120 MJ/cm2。
19. 接着进行步骤20的操作或将膜放在两层保鲜膜之间,在 4 ℃可保存6个月。
20. 将膜放入可加热封闭的大袋子中,加入500 ml 封阻液Ⅰ,小心排去气泡,密封口袋,放置10 min。
21. 按下述过裎处理膜
(1)200 ml 偶联物缓冲液20 min
(2)500 ml 封阻液15 min
(3)500 ml 洗涤缓冲液Ⅰ10 min,3次
(4)500 ml 分析缓冲液2 min
(5)50 ml 二氧杂环丁烷检测5 min
21. 从袋子中排出过量的检测液,平整所有的皱折,重新密封口袋。
22. 室温将包着的膜直接与X光感光片接触使之曝光。