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用碱和SDS处理可以从小量（1-2ml）细菌培养物种分离质粒DNA，所获得的质粒则可以用电泳或限制性核酸内切酶笑消化的方法鉴定；经聚乙二醇处理进一步纯化后，可以用做DNA测序反应的模板。
1. 挑转化后的单菌落，接种到2ml含有适当抗生素的丰富培养基中（LB），于37度剧烈振摇下培养过夜。注意试管不能盖紧。
2. 将1.5ml培养物倒入微量离心管，用微量离心机于4度12000转离心30s，将剩余的培养物置于4度。
3. 离心结束，尽可能吸干培养液。（未完全除去培养液会影响到后面限制性内切酶的活性）
4. 将细菌重悬于100ul预冷的碱裂解液I中，剧烈振荡。
5. 加200ul新配置的碱裂解液Ⅱ于每管细菌悬液中，盖紧管口，快速颠倒离心管5次，不要振荡，将离心管放置于冰上。
6. 加150ul预冷的碱裂解液Ⅲ，盖紧管口，反复颠倒数次，使溶液Ⅲ在黏稠的细菌裂解物种分散均匀，置于冰上3-5min。
7. 4度12000转离心5min，将上清转移到新的离心管中。
8. 加等量体积的酚：氯仿，振荡混合有机相和水相，然后4度12000转离心2min，将上清转移到新的离心管中。
9. 用两倍体积的乙醇于室温沉淀核酸，振荡混匀，于室温放置2min。
10. 用微量离心机于4度12000转5min，收集沉淀的核酸。
11. 小心吸去上清液，将离心管倒置于纸巾上，使所有的液体流出排干。
12.加1ml 70%的乙醇于沉淀中并将盖紧的试管颠倒数次，4度12000转离心2min，回收DNA。
13. 吸除上清液，将开口的试管置于室温使酒精挥发，直至没有液体。
14. 用50ul含有DNA酶的RNA酶A（20ug/ml）的TE重新溶解核酸，温和振荡几秒钟，储存于-20度。
