植物RNA的制备实验
1. 研钵和研棒先用液氮冷却,称出15 g 冻结植物组织于研钵中(加液氮保持冻结)。
2. 用研棒磨成粉末,立即转移到一个盛有150 ml,研磨缓冲液和50 ml TLE缓冲液平衡酚的500 ml 烧杯中。
3. 用Poltroon匀浆器,设定在5~6挡匀浆2 min,加入50 ml 氯仿,并用匀浆器在低速下混匀。
4. 将混合物移至500 ml 的Nalgene离心瓶中,于50℃加热20 min。
5. 于4℃用JA-10转子在17 700 g 下离心20 min。
6. 将上层水相移至另一个干净Nalgene离心瓶中(界面保留待后继步骤4处理),加入50 ml TLE缓冲液平衡酚,混匀,再加50 ml 氯仿。
7. 将上步残余的水相连同界面上的物质移入一 50ml Oak Ridge离心管中,于4℃用JA-20转子12 100 g 离心20 min。
8. 吸出水相、与步骤3的水相和酚、氯仿混合物合并,剧烈混和。
9. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心15 min,水相移入另一干净500 ml 离心瓶。
10. 用TLE平衡分反复抽提水相,直至两相间界面干净为止,水相再以氯仿抽提。
11. 将水相移入250ml Nalgene离心瓶中,加入LiCl至终浓度为2 mol/l(加约0.33体积的8 mol/l LiCl),在4℃沉淀过夜。
12. 于4℃用JA-14转子15 300 g 离心20 min,沉淀以2~3 ml,2 mol/l LiCl溶液冲洗。
13. 沉淀以5 ml 水重溶,并移入15 ml Sarstedt 离心管中,加入LiCl溶液至2 mol/l于4℃沉淀RNA 2 h 以上。
14. 于4℃用JA-20转子15 300 g 离心20 min,用2 mol/l LiCl溶液沖诜一下,重溶干2 ml。
15. 加入200 μl 3 mol/l 乙酸钠溶液和5.5 ml无水乙醇,-20℃沉淀过夜或在干冰/乙醇中沉淀30 min。
16. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心15 min,用1 ml 水重溶沉淀,取10 μl 稀释至1 ml 测A260和A280。