细菌RNA制备实验-革兰氏阳性细菌中提取
1. 于4℃ 12 000 g 离心从10 ml 细菌培养物回收细胞。
2. 重悬菌体于0.5 ml 裂解缓冲液,并移入微量离心管中,在干冰中冻结。
3. 解冻并用微探头超声发生器以30W超声3次,每次10 s (避免起泡),37℃温育60 min。
4. 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提,于室温微量离心机高速离心5 min,上层水相移入另一干净微量离心管中。
5. 用酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)再抽提1次,再用氯仿/异戊醇(24:1)抽提1次。
6. 400 μl 水相加入15 μl 5mol/l NaCl,并加满冰冷的无水乙醇,混匀并于冰上放置15~30 min,或于-20℃过夜。
7. 于4℃微量离心机离心15 min,沉淀用冰冷的70%乙醇冲洗,晾干。
8. 用95 μl DNA酶消化缓冲液溶解沉淀,加4 μl 2.5 mg/ml 无RNA酶的DNA酶Ⅰ,37℃温育60 min。
9. 用酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提1次,移出水相,有机相加入100 μl 缓冲液,混匀,于室温微量离心机高速离心5 min,合并两次的水相。
10. 用氯仿/异戊酵(24:1)抽提1次,加入10 μl 5mol/l NaCl和600 μl 无水乙醇,在-20℃过夜或置于干冰/乙醇中15 min。
11. 用微量离心机于4℃下高速离心15~30 min。
12. 用500 μl 70%乙醇洗涤沉淀,晾干,溶解于100 μl DEPC处理过的水。
13. 取10 μl 稀释于1 ml 水,测A280和A260以定量,保存于-70℃或以乙醇沉淀的形式保存。