2.1.5 CsCl法从培养细胞中提取RNA
磷酸盐缓冲溶液 (PBS) 硫氰酸胍溶液:4 mol/L 硫氰酸胍,0.lmmol/L Tris-HCl pH7.5,1%β-巯基乙醇 CsCl 5.7mol/:L (DEPC 处 理) TES 缓冲液:0.1% SDS,10mmol/ LTris-ClpH 7.4 ,lmmol/ LEDTA 3 mmol/L 乙酸钠缓冲液 ( PH5. 2,DEPC处理) 无 水 乙 醇 经 DEFC 处理的水 离心机 6m l注射 器 及 20W 针头
1. 单层培养细胞
1 ) 室温 下 用 PBS 洗涤细胞,每 平 皿 5 ml 洗 涤 2 次 。
2 ) 在 不 超 过 10
5 个细胞中加人 3 . 5 ml 硫氰酸胍溶液,使之遍布整个平皿 。 用橡胶细胞刮于擦刮平皿,回收黏稠的细胞裂解液,用 装 有 20-G 针头的注射器往返抽吸裂解物,舍并在一起
2 . 悬浮培养细胞
1 ) 离心回收 ≤l0
8 个细胞,用 相 当 于 1 /2 原 有 体 积 的 PBS 重 悬 之 ,并再次离心回收细胞。
2 ) 往离心管中加人 3.5m l 硫氰酸胍溶液。
3 ) 用 装 有 20-G 针 头 的 6m l 注射器将黏稠的细胞裂解液往返抽吸 4 次 ,并将其移至一个干净的试管中。本 步 骤的重要性在于可对染色体 DNA 进行剪 切 ,以降低溶液的黏度 ,
4 ) 在 经 硅 化 井 高 压 过 的 13 mmX 51m m 的 超 速 离 心 管 中 ,加 人 1.5 ml5.7mol/LCsCl 并 在 CsCl 层 加 人 3. 5m l 细胞裂解液,界面应保持清晰。 1 )〜 4 ) 步的操作均在室温进行。
5) 于 18℃,150 OOOg 离 心 12〜 20 h(缓慢加速和减速)
6) 用巴斯德吸管的管尖在液面 1: 吸 取上 清 ,管子随液面的下降而下降。当吸至仅剩约 100u1 时 ,小心倒置管子,倒出剩余液体□在界面处应有一白色的 DNA 带 ,必须仔细地完全移去此带,因为它含有染色体 DNA。
7 ) 晾于沉淀约 5〜 lOmin,然 后 以 360ul TES 溶液重溶沉淀,反复用吸管上下抽吸,如此在室温逬行 5〜 lOmin,转移溶液于另一干净的微量离心管。
8) 加 人 40u1 3mol/L pH5. 2 的乙酸 钠 缓 冲 液 和 1m l 无水 乙 醇 ,在干冰/ 乙醇中沉淀30mim,离 心 10〜 15 min, 用 360 ul 水重溶沉淀并重复沉淀过程。
9 ) 沉淀晾干 lO min, 溶 解 于 20 ul 水 中 ,取 10 ul 稀 释 至 lml ,测 A260 和 A280.最 后 ,以水溶液或乙醇沉淀的形式在 一 70℃ 储 存 RNA。
注意事项
1 ) 要用足够的时间去重溶沉淀,否则 RNA 的产量会有显著下降。
2 ) 小 RNA 在 CsCl 中离心时不能有效地沉淀,因 此 不 能 用 此 方 法 制 备 5S RNA 和
tRNA 等分子。
3 ) 乙醇可以洗去沉淀中的氯化铯. 使沉淀易于溶解