Nature Communications —陈功友团队揭示植物病原菌拮抗活性物吡唑三嗪的生物合成与调控机制
植物在生长发育过程中受到各种病原菌的侵染危害，导致植物死亡和造成显著经济损失。农作物抗病育种和使用绿色农药是防控作物重大致灾病害的有效途径,而绿色农药可以来自植物生长环境中产生抗生素的生防微生物。2023年2月9日，Nature子刊Nature Communications在线发表上海交通大学农业与生物学院陈功友教授和生命科学技术学院林双君教授联合团队的“The natural pyrazolot
Cell Discovery |高绍荣/陈嘉瑜/张勇/李晓翠合作阐明组蛋白修饰调控人类原始生殖细胞发育关键事件的表观遗传机制
哺乳动物原始生殖细胞（Primordial germ cell，PGC）是生殖细胞的前体，最终发育产生高度特化的配子——精子和卵子。原始生殖细胞的正确发育是维持物种内遗传稳定性和连续性的必要条件，由此保证了遗传和表观遗传信息能忠实地从一代传递至下一代。原始生殖细胞在发育中经历了非常独特的事件，包括细胞的迁移、生殖嵴定位、性别决定、减数分裂和配子成熟等过程。更为重要的是，在这一进程中原始生殖细胞的
晚期前列腺癌治疗效果可预测，“复旦肿瘤”专家建立评估模型
前列腺癌是我国男性人群恶性肿瘤发病率增长最快的恶性肿瘤。以上海市浦东新区为例，前列腺癌已经跃居男性恶性肿瘤发病率第四位。由于缺乏筛查，近一半国人前列腺癌患者在初诊时就存在转移。药物治疗是控制晚期前列腺癌患者疾病、延长生存期的关键。然而，前列腺癌存在显著的异质性，不但不同患者之间病情差异显著，且同一患者不同病灶之间也是“各怀鬼胎”——恶性程度和治疗反应各不相同。转移性前列腺癌的治疗效果更是难以
Nature Communications | 酒亚明/唐宏/魏珂课题组合作揭示沙门氏菌毒力因子SopB挟持宿主细胞中间丝促进细菌复制
沙门氏菌（Salmonella）作为一种常见的人畜共患病原菌，是导致腹泻病最常见的致病菌之一。腹泻病是由不安全食品造成的最常见疾病，每年有5.5亿人患病，23万人死亡，成为全球重大的公共卫生问题。随着抗生素的滥用，沙门氏菌的耐药现象日益严重，随着时间的推移，其耐药率正在大幅上升，耐药谱也在不断增宽。近期研究发现沙门氏菌中出现多达36处突变基因，对包括头孢霉素、青霉素、四环素等在内的14种抗生素产
上海交通大学基础医学院高小玲课题组发表“纳米刹车”阻断线粒体功能障碍级联反应改...
近日，上海交通大学医学院高小玲教授和上海中医药大学陈红专教授团队合作在国际权威杂志《先进科学》（Advanced Science）正式发表了题为“Nano-brake Halts Mitochondrial Dysfunction Cascade to Alleviate Neuropathology and Rescue Alzheimer’s Cognitive Deficits”的研究论文。
复旦肿瘤专家首次揭露HPV相关口咽癌免疫微环境独特T细胞亚群
近日，复旦大学附属肿瘤医院放射治疗中心头颈专科陆雪官教授领衔其团队，历经近4年探索并完成了一项人乳头瘤病毒（HPV）相关口咽癌免疫微环境特征的转化研究。通过采用单细胞RNA测序技术，首次揭示了HPV相关口咽癌内存在一类兼具激活与耗竭表型的CD161+细胞毒性T淋巴细胞（CTL）亚群，其产生与HPV感染密切相关，并在临床样本中证明，CD161+CTL较CD161-CTL具有更强的免疫应答功能，其T细
PNAS # 海交通大学薛红卫课题组与合作者揭示磷脂酸细胞器间转运进而调控叶绿体发育的机制
光合真核生物将太阳能转化成化学能，这一过程为地球生命提供了赖以生存的食物和能量。叶绿体内囊体膜是实现光合作用过程的必要场所，并由合适的脂类组装以保证其功能的发挥。磷脂酸（phosphatidic acid，PA）是内囊体膜脂质合成的重要前体。PA主要在内质网合成，并被转运至叶绿体进一步加工合成糖脂（内囊体特有且重要的脂类）。然而，脂质从其它细胞器转运到叶绿体的分子基础仍有待进一步阐明。
Nucleic Acids Research | 胡晋川/钱茂祥合作团队开发单碱基分辨率蛋白-DNA损伤相互作用测序方法
DNA加合物损伤可以由多种外源因子诱导产生，包括阳光中的紫外线、顺铂等化疗药物、香烟和汽车尾气中的苯并芘以及来自霉变食物的黄曲霉素B1等。它们会干扰DNA复制和转录，诱导突变和细胞死亡，最终导致癌症及其它疾病。在包括人类在内的高等哺乳动物中，核苷酸切除修复是唯一能修复DNA加合物损伤的途径。根据损伤识别方式的不同，核苷酸切除修复分为全基因组修复和转录偶联修复两条亚途径，前者的分子机制已
华中科技大学基础医学院方超教授团队在抗血栓药物研究领域连续取得进展
基础医学院药理学系方超教授课题组联合药学院姚广民教授课题组连续在抗血栓药物/药理学研究领域取得进展，成果相继在线发表在药理学/药物化学领域顶级期刊《英国药理学杂志British Journal of Pharmacology》以及《美国化学会会刊Journal of the American Chemical Society》。
Briefings in Bioinformatics ｜同济大学王晨飞课题组开发单细胞CRISPR筛选数据综合分析流程SCREE
CRISPR筛选（CRISPR-screen）技术基于测序手段量化靶向目标基因的sgRNA在筛选前后的变化，目前被广泛用于筛选与特定功能表型（如细胞生长，分化，免疫耐受或耐药）相关的候选基因。虽然CRISPR筛选能在一定程度上研究基因功能，但是这一技术仍然存在很大的局限性，无法研究目标基因下游的调控机制。近年来，随着一系列高通量单细胞测序技术的出现与普及，近期的研究将CRISPR筛选与单细胞转录
NAR┃甘建华/盛佳团队首次揭示DNA适配体结合Cd2+的机制
镉是毒性最强的金属元素之一，可以通过不同的途径进入人体。长期暴露在镉污染的环境中，人体的骨骼、肾脏、呼吸系统以及生殖系统的功能都会受到严重的影响。因为对人类健康以及生态环境的严重威胁，镉污染受到了广泛的关注，多种Cd2+离子检测方法已经被报道。传统的Cd2+离子检测方法需要依赖复杂的仪器和样品预处理过程，检测的时长和成本都十分高，阻碍了其在实际检测中的应用。近年的研究发现一些DNA适配体
复旦大学罗小金课题组揭示油菜素甾醇和生长素协同调控水稻株高和粒长的分子机制
株高和粒型是决定水稻产量的两个重要的农艺性状，油菜素甾醇（BR）在水稻株高和粒型的调控中发挥着重要的作用。目前，水稻中已有较多的BR合成或信号通路相关的基因被克隆，也揭示了部分株高与粒型调控相关的机制，但期间的分子调控网络复杂，仍许多未知有待进一步研究。此外，BR也会与其他激素（如生长素）协同调控水稻株高和粒型，但其中的机制仍然知之甚少。 2023年3月24日，复旦大学罗小金课题组在F
华中科技大学基础医学院季维克团队在细胞器膜接触领域取得创新进展
近日，华中科技大学基础医学院生物化学与分子生物学系季维克教授团队在Journal of Cell Biology发表了最新研究：Tex2 is required for lysosomal functions at TMEM55-dependent ER membrane contact site。研究鉴定了新的内质网-溶酶体膜接触蛋白Tex2，并解析了功能。从膜接触角度解析溶酶体功能调控新机
J Clin Invest丨复旦大学桑庆/王磊团队与合作者发现α核转运蛋白缺陷 导致人类植入前胚胎停滞新机制
植入前胚胎停滞（Preimplantation embryo arrest，PREMBA）是导致辅助生殖反复失败的主要原因之一，表现为受精后第三天无法形成有效8细胞胚胎，或第五天无法形成囊胚。之前已知基因及机制集中于母源机制复合体成员突变及异常，且仅能解释少部分患者，那么PREMBA患者背后还隐藏着哪些未知的致病因素？是否存在新的分子机制？ 2023年1月18日，复旦大学生物医学研究院
Cell Reports |中国科大申勇课题组揭示补体抑制蛋白调控大脑抑制性突触传递机制
中国科大申勇教授课题组发现内源性补体抑制蛋白CD59调控抑制性突触传递功能及空间参考记忆能力。相关研究成果以“The Complement Inhibitor CD59 Regulates GABAergic Synaptic Transmission in the Dentate Gyrus”为题，于2023年4月5日在线发表于《Cell Reports》上。 补体系统是天然免
武汉大学赵华斌团队提出动物味觉基因与食性演化的新假说
近日，武汉大学生命科学学院生态学系赵华斌教授课题组在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了题为“Evolution of bitter receptor genes and ontogenetic dietary shift in a frog”（蛙类苦味受体基因的演化及其在个体发育过程中的食性转变）的研究论文。该研究揭示了蛙类从幼体到成体的食性与苦味受体基因家族的关联演化，
NAR∣武汉大学生命科学学院陈向东/杜世燊组发现枯草芽胞杆菌细胞间遗传转化中大规模的基因组片段转移
细菌通过水平基因转移（horizontal gene transfer, HGT）获取新的DNA，如果转移的DNA被保留在受体细胞中，则受体细胞的生理和活性可能会被转移的DNA中编码的基因显著改变(1,2)。这一过程有助于细菌的基因组多样性，使其快速适应不断变化的环境条件并提供竞争优势，同时也促进了细菌病原体中致病性基因岛和抗生素抗性基因的传播(3,4)，由此引起的抗菌素耐药性导致的公共卫生挑
北京师范大学井健课题组在International Journal of Molecular Sciences发表文章发现靶向整合素增强Annexin V抗小鼠黑色素瘤效应
Annexin V（ANV）属于膜联蛋白超家族，最初作为一种抗凝血蛋白被发现，由于其具备钙依赖性磷脂酰丝氨酸（PS）的高结合亲和力，很快作为一种新型细胞凋亡生物标志物受到关注。细胞凋亡时PS被翻转到外小叶，这是吞噬细胞的主要调控信号之一。肿瘤细胞膜外小叶存在高水平PS，并且肿瘤细胞的PS外化与细胞凋亡无关。PS异常化分布存在于肿瘤血管内皮细胞管腔表面，但不存在于正常组织。因此ANV对PS的高亲和力
北京师范大学生命科学学院刘光伟课题组发现中性粒细胞肿瘤免疫调控新机制
结直肠癌症是全球第三大常见癌症，也是导致癌症死亡的第二大原因。慢性炎症常常破坏肠粘膜和肠道微生态屏障，直接诱发结直肠癌症。然而，免疫和肠道微生态在癌症发生发展中的调控机理尚不清楚。 2023年3月1日，北京师范大学生命科学学院刘光伟教授团队和军事医学研究院杨瑞馥研究员、毕玉晶研究员团队合作在Journal of Experimental & Clinical Cancer Researc
北京师范大学生命科学学院庞尔丽教授课题组在Horticulture Research发表预测植物基因组潜在顺式调控元件的新方法
2023年2月28日，庞尔丽教授课题组在Horticulture Research（IF2022=7.3）发表题为“Identification of Clade-wide Putative Cis-regulatory Elements from Conserved Non-coding Sequences in Cucurbitaceae Genomes”的研究论文，以葫芦科物种