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Ualcan: 首选的在线TCGA各肿瘤分析工具
做肿瘤研究一般是两种情况：
1. 没有确切的研究蛋白，想知道某种肿瘤中差异表达排名靠前的基因有哪些，好筛选一些可做的基因蛋白。
2. 有确切的蛋白，想验证其在各种肿瘤中的表达情况以及和生存相关性。
Ualcan这个工具能够完美地帮你解决上述两个问题（当然，其不止上述两个功能）
1. 我们首先打开首页，选择下图中的TCGA analysis:
2. 然后，选择页面左边的导航菜单，这里我们选择乳腺癌，直接点击左边的链接。
3. 接下来，在乳腺癌中高表达（癌vs癌旁）和低表达的前250个基因就罗列出来了。
4. 上图展示了乳腺癌中高表达基因的前25个的热图，同样在页面的下方也展示出来了低表达的热图：
5. 上述热图左边的基因名称可直接点击，会跳转到该基因的表达、生存、甲基化、相关性页面，非常方便。
同时，乳腺癌有很多亚型，UalCan帮您区分了亚型，你可以将鼠标放在左边导航栏的下箭头处，然后选择对应的亚型
6. 不同肿瘤亚型都给列出来了，比如结肠癌的：
7. 如果你研究的是某几个具体的基因，Ualcan同样提供了根据基因查询的功能，回到主页：
8. 然后点击Explore，直达如下结果：
9. 下图展示了ERBB2基因的表达，同时可以选择分组类型：
10. ERBB2的生存曲线，同样也可以选择分组：
11. 除了选择自己的几个基因之外，Ualcan还提供一些信号通路基因的查找，回到首页，如下图，选择P53通路：
12. 结果如下，展示了P53通路相关蛋白的情况，下图中，红色阴影背景的表示其在当前肿瘤中高表达，蓝色阴影背景的表示在当前肿瘤中低表达，无背景阴影的表示无显著差异。
13, 另外Ualcan还提供miRNA的表达分析，和上面基因表达分析一样，这里就不做介绍。
14, 此外，Ualcan还可以进行蛋白质组学分析，以及儿童脑肿瘤数据分析
Ualcan网址：http://ualcan.path.uab.edu/
http://www.keyangou.com
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