服务热线
178 0020 3020
bc-GenExMiner: 墙裂推荐！乳腺癌研究的绝佳工具
肿瘤在线分析工具见得很多了，但是专门针对某一种肿瘤做的如此好的我才发现一种。
就是今天我们介绍的bc-GenExMiner，针对乳腺癌数据的在线分析工具。
1. 首先打开主页，该工具集成了11359个乳腺癌芯片的数据以及4712个RNA-seq的数据，数据量还是非常的大。
2. 点击菜单栏“Analysis”，大致分为三种分析：相关性分析，表达分析和生存分析。
3.我们首先看下相关性分析。Targeted可以进行多个基因之间相关性分析。如下图，我们输入一些基因名称。注意：输入基因的名称必须经过系统验证。
4. 然后结果如下，点击下图中右下角的图标
结果展示如下：
5. 接下来我们看下相关性分析的第二个类型：exhaustive analysis，当前分析模式是研究与某一个基因最相关的其他基因，比如研究TP53基因的相关性基因：
6. 上图中输入框只能输入一个基因名称，我们输入TP53，结果如下：
从上图中可以看出，乳腺癌中与TP53正相关表达的基因最高的是ATP2C2-AS1，考虑到P53是一个转录因子，因此在乳腺癌中TP53是否也可以通过促进ATP2C2-AS1的表达进而抑制肿瘤发生发展呢？在右边展示了与TP53负相关的基因，那么在在乳腺癌中GAGE12E是否抑制TP53的表达从而促进肿瘤发生发展呢？一个课题就这样诞生了，有理有据的开头！（当然，单纯这个证据还不行，还得参考表达、生存等信息）
7. 接下来我们看下第二个模块：表达，同样以TP53为例：
8. 结果可厉害了，可以按照各种分组给出TP53的表达水平，并且还有4中展示方式：
9. 再来看看第三个功能：生存分析
结果同样很厉害，乳腺癌按照ER，PR等分组，分别计算出了风险值和P值，结果一目了然。
所有的上述图片和表格均可以导出！
bc-GenExMiner：http://bcgenex.ico.unicancer.fr/BC-GEM/GEM-requete.php
http://www.keyangou.com
附件