CellMarker: 人类&小鼠组织细胞(正常&肿瘤)Marker大全

小小米 2021-08-03 09:39:27 阅读: 3797

100000篇已发表的论文整理

4124条条目

158个人体组织/子组织

467种细胞类型

13605个细胞标记物

81个小鼠组织/子组织

389种细胞类型的

9148个细胞标记物

构成了CellMarker数据库!

今天我们就来看看这个由哈尔滨医科大学发表在Nucleic Acids Res上面的数据库

1首先打开首页,一张人体图直观地展示了当前数据库的数据,点击对应的条目可跳转到详细信息。

2. 我们点击导航栏的“Browse”,进入详细浏览界面,左边是分类,包括人类的各种组织细胞和小鼠的各种组织细胞。

3.比如我们想看人类棕色脂肪组织的Marker是什么,可以看出UCP1是其Marker。

4. 再比如,想看下肺的肿瘤干细胞标记物有哪些,下图用词汇云表示出来了肺肿瘤干细胞的标记物,很直观的看出CD133, CD44, ALDH1是其最常见的标记物,字体越大代表越显著可用。

5. 同时你可以直接将这些标记物下载下来:

6. 接下来还可以直接搜索,可以输入组织名称或者细胞名称查看对应的Marker

7. 反过来,你可以说输入Marker看看有哪些组织和细胞:

比如输入CD133,可以得出一张矩阵图,展示了CD133在哪些组织的哪些细胞中可作为Marker

8. 最后,该工具提供了数据下载:

下载的txt用Excel打开后,可以看出信息十分全面

 

CellMarker地址:http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/

收藏备用!

 

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