HumGut: 人类肠道原核参考基因组数据集

小小米 2021-09-08 22:20:14 阅读: 1178

在进行二代测序的一个关键步骤就是把序列比对到参考组上。这样才能知道检测的序列是什么基因/生物。而在人类肠道微生物组研究中使用宏基因组测序的一个主要瓶颈是缺乏可用作参考数据库的综合基因组集合。因此就有了HumGut(http://arken.nmbu.no/~larssn/humgut/) 这个基因集。这个是作者通过筛选了 > 5,700 个健康的人类肠道宏基因组最后得到的集合。

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在 HumGut 里面提供了参考基因组比对的Fasta的数据库。同时也提供了一个表格的数据。方面了解得到的原核生物基因组的具体信息。

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