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CPTAC(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium)于2021年4月以封面形式在Cancer Cell上发表了“Proteogenomic and metabolomic characterization of human glioblastoma”,研究团队整合分析了10个平台的蛋白质基因组学和代谢组学的数据,包括全外显子测序(WES),RNA测序(RNA-seq),microRNA-seq (miRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq)、DNA甲基化芯片、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学、脂质组学和代谢组学。并且研究团队对99例未经治疗的GBM进行了基因组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学和代谢组学研究。研究结果发现PTPN11和PLCG1的磷酸化是介导肿瘤发生的关键因素。并且通过免疫细胞分型(xCell)将GBM分为四个免疫亚型:IM1型特征包括高水平的小胶质细胞、巨噬细胞和淋巴细胞;IM2和IM3型主要根据巨噬细胞和淋巴细胞数目比值进行区分,IM2型中巨噬细胞数目较高、而淋巴细胞较低,IM3中神经元评分高;IM4型区别于其他类型,主要特征是所有的免疫细胞低浸润。与传统的分型相比较,间质型GBM主要富集在IM1和IM2型中,IDH-MT型主要富集在IM3型中。
本研究通过GBM样本多组学多维度分析,为GBM发生的分子机制提供了新的见解。研究结果将可能改善临床试验中患者分组,为个性化治疗提供指导。
原文链接:
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.01.006
参考文献:
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