Cancer Cell # STC1是一个新的免疫抑制和耐受的检查点

长风大侠 2021-05-07 14:28:39 阅读: 1524
胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是中枢神经系统最常见的原发恶性肿瘤,在美国每年约有12000例新发病例,并且中位生存时间仅2年[1]。TCGA项目已经对GBM进行了分子分型,主要分为IDH突变型(IDH-MT,约10%)IDH野生型(IDH-WT,约90%), IDH-WT的GBM可分为三个亚型:原神经型,经典型和间质型[2]。手术切除、化疗和放疗仍然是GBM标准的 治疗方案。尽管近年来免疫疗法(免疫检查点抑制剂、CAR-T)提供了新的治疗思路,但是到目前为止还没有一种免疫疗法能通过三期临床试验[3]。基于转录组特征分型的GBM亚型并没有为治疗方案带来有意义的指导性意见,可能是由于转录组分型还不能很好地区分GBM的亚型。




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    CPTAC(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium)于2021年4月以封面形式在Cancer Cell上发表了“Proteogenomic and metabolomic characterization of human glioblastoma”,研究团队整合分析了10个平台的蛋白质基因组学和代谢组学的数据,包括全外显子测序(WES),RNA测序(RNA-seq),microRNA-seq (miRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq)、DNA甲基化芯片、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学、脂质组学和代谢组学。并且研究团队对99例未经治疗的GBM进行了基因组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学和代谢组学研究。研究结果发现PTPN11和PLCG1的磷酸化是介导肿瘤发生的关键因素。并且通过免疫细胞分型(xCell)将GBM分为四个免疫亚型:IM1型特征包括高水平的小胶质细胞、巨噬细胞和淋巴细胞;IM2和IM3型主要根据巨噬细胞和淋巴细胞数目比值进行区分,IM2型中巨噬细胞数目较高、而淋巴细胞较低,IM3中神经元评分高;IM4型区别于其他类型,主要特征是所有的免疫细胞低浸润。与传统的分型相比较,间质型GBM主要富集在IM1和IM2型中,IDH-MT型主要富集在IM3型中。


    本研究通过GBM样本多组学多维度分析,为GBM发生的分子机制提供了新的见解。研究结果将可能改善临床试验中患者分组,为个性化治疗提供指导。


原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.01.006


参考文献:

[1] CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2012–2016. https://doi.org/10.1093/neuonc/noz150

[2] Tumor Evolution of Glioma-Intrinsic Gene Expression Subtypes Associates with Immunological Changes in the Microenvironment. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2017.06.003

[3] Current State of Immunotherapy for Treatment of Glioblastoma. https://doi.org/10.1007/s11864-019-0619-4


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